Lalnview para visualizar alineaciones locales entre dos secuencias
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Lalnview Clasificación y resumen

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vista espectador alineación alineación de secuencia Ver alineación visor de alineación

Lalnview Descripción

Herramienta para visualizar alineaciones locales entre dos secuencias. LALNVIEW es un programa gráfico de código abierto y gratuito para visualizar alineaciones locales entre dos secuencias (proteínas o ácidos nucleicos). Las secuencias están representadas por rectángulos de colores para dar una imagen general de las similitudes entre las dos secuencias. Los bloques de similitud entre las dos secuencias se colorean de acuerdo con el grado de identidad entre segmentos.LalnView también puede mostrar las funciones de secuencia (sitio activo, dominio, motivo, propéptido, exón, intrón, promotor, etc.) junto con la alineación. Esto permite que uno haga el enlace entre similitud de secuencia y funciones conocidas. Cuando se usa LALNVIEW a través de estos servidores, las funciones de secuencia se extraen automáticamente de las anotaciones de la base de datos y se muestran con la alineación. Se muestran las secuencias de texto en una ventana secundaria. Al hacer clic en un bloque, el usuario puede visualizar la alineación local correspondiente. El dominio se puede repetir en una secuencia, el clic iterativo en un bloque mostrará sucesivamente todos los bloques similares que se producen en la otra secuencia.

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