METELFREE Se adapta a los parámetros sin modelo a las tasas de relajación.
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METELFREE Clasificación y resumen

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datos parámetro optimizar Optimizar los parámetros Datos heteronucleares optimizar los datos

METELFREE Descripción

Se adapta a los parámetros sin modelos a las tasas de relajación. Modelfree es un programa diseñado para optimizar los parámetros "LIPARI-SZABO MODEL MODEL FREE" a los datos de relajación heteronuclear. Modelfree es un programa para adaptarse a la función de densidad espectral sin modelo extendida a los datos de relajación de RMN. El programa puede analizar la constante de tasa de relajación de la celosía de giro (R1), la constante de la tasa de relajación de giro de giro (R2) y el efecto heteronuclear en estado estacionario {1H} -x Efecto de la overlama nuclear (NOE) para cualquier combinación de 13C y 15N Gira a hasta cinco campos magnéticos estáticos. El algoritmo asume los mecanismos de relajación de anisotropía (CSA) dipolares y químicos para R1, R2 y la NOE e incluye un término aditivo para tener en cuenta la ampliación del intercambio químico de R2. El parámetro de ampliación de Exchange se escala de forma cuadrática con respecto al campo magnético estático si hay datos para más de un campo disponible. Las descripciones de los principios principales utilizados en el programa para la selección de modelos, la optimización y el análisis de errores utilizan previamente las simulaciones de Monte Carlo (Palmer et al., 1991; Mandel et al., 1995) .Modelfree incorpora tres modelos para la difusión de rotación. El método de Brent se utiliza para optimizar un solo τM global para un modelo de difusión general isotrópico. El método de Powell (según lo implementado por Brent) o un protocolo de recocido simulado (basado en el método simplex simple) se usa para optimizar un tensor de difusión de rotación global para un modelo de difusión axialmente simétrico. Un tiempo de correlación de rotación local, τmi, para cada giro puede optimizarse por regresión de mínimos cuadrados no lineales. Otros parámetros gratuitos de modelo interno (parámetros de pedido, tiempos de correlación interna y términos de intercambio químico) están optimizados por mínimos cuadrados no lineales restringidos. Cualquier parámetro se puede fijar en su valor de entrada en lugar de optimizado ND Los límites simples se pueden colocar en cualquier parámetro. Las simulaciones de Monte Carlo se utilizan para estimar las incertidumbres en los parámetros sin modelos y para realizar la selección de modelos estadísticos basados ​​en las pruebas F. Una buena discusión introductoria sobre el uso de simulaciones de Monte Carlo en el análisis de errores se da por Press et al. (Presione et al., 1986). ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Soporte finalizado para la plataforma SGI. Solo Linux y Mac OSX son plataformas compatibles en la actualidad. · Criterios de terminación fija y distribución simulada de error F-estadística. · Un error identificado por Edward d'Auverny que hizo que el algoritmo de minimización terminara de manera inadecuada después de que se haya solucionado una etapa de optimización fallida. · Se ha solucionado un error en la prueba por si los parámetros limitados se podrían devolver al conjunto activo. · Se cambió la búsqueda de cuadrícula para que los límites superiores e inferiores exactos no sean puntos de búsqueda de cuadrícula. · El número máximo de residuos se incrementó a 300.

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