MIDAS Sistema de análisis de datos de microarrays gratis
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Sistema de análisis de datos de microarrays gratis El sistema de análisis de datos de Microarray es una aplicación Java gratuita que proporciona a los usuarios una interfaz intuitiva para diseñar protocolos de análisis que combinan una o más medidas de normalización y filtrado. De esta manera, los datos de muchas hibridaciones individuales se pueden tratar de manera uniforme y reproducible. MIDAS lee los archivos ".TAV" generados por Tigry SpotFinder o recuperado de la base de datos a través de Madam. Los módulos de normalización incluyen regresión lineal ponderada localmente (de baja presión; (Cleveland y Devlin, 1988; Yang et al., 2002)) y la normalización de intensidad total. Estos se pueden vincular con filtros, incluidos el corte de baja intensidad, los límites de puntuación Z dependientes de la intensidad, y replican el recorte de consistencia, creando un método altamente personalizable para preparar datos de expresión para comparación y análisis posteriores. Los métodos de análisis de datos se construyen utilizando un lenguaje de secuencias de comandos gráficas intuitivas y se puede guardar para su aplicación a otros conjuntos de datos. MIDA proporciona aparatos de dispersión que ilustran los efectos de cada algoritmo en los datos. Cuando se completan los pasos de normalización y filtrado, MIDA emite los datos en formato TAV. Requisitos: · Java 1.4.1 o posterior

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