Maexplorer MaExplorer - Facilidad de minería de datos basada en Java para cajas de datos de microarray de CDNA u Oligonucleiotiide
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Maexplorer - Facilidad de minería de datos basada en Java para cajas de datos de microarray de ADNc o Oligonucleiotiide MaExplorer (Microarray Explorer) es una instalación de minería de datos basada en Java para las bases de datos de Microarray de ADNc o Oligonucleiotiide. Su entorno de análisis de datos exploratorios proporciona herramientas para la extracción de datos de los perfiles de expresión cuantitativa a través de múltiples microarrays.Microarray Los datos se pueden ver e directamente manipulados en pseudoimágenes de matriz, parcelas de dispersión, histogramas, parcelas de perfil de expresión, análisis de clústeres (genes similares, k-medios o k-mediana, agrupación jerárquica, etc.), e informes. Una característica clave son los filtros de datos genéticos para restringir un conjunto de genes de trabajo a aquellos que pasan una variedad de pruebas y condiciones especificadas por el usuario. Los informes se pueden generar con acceso a la web de hipertexto a bases de datos genómicas, como una base de datos UNIGENE, LOCUSLINK, DBEST, NCI / CIT MADB MICROARRANY, la imagen, Genbank y otras bases de datos de Internet para conjuntos de genes que se encuentran en interés. Un enfoque principal de esta herramienta Es la minería de datos interactivos con acceso a otras bases de datos genómicas web de soporte. El énfasis en la manipulación directa de los genes y los conjuntos de genes en gráficos y tablas proporciona un alto nivel de interacción con los datos que facilitan la facilidad de que los investigadores prueben ideas al buscar patrones. La API de Java abierta de Maexplorer está disponible para crear sus propios MaePlugins Java . Esto le permite agregar sus propias herramientas analíticas, así como las creadas por otros investigadores para extender la funcionalidad de Maexplorer. Estos podrían incluir agregar nuevos métodos de análisis al sistema base, como las pruebas estadísticas, la normalización, la agrupación, el cliente-servidor, etc., hay algunas características clave de "maexplorer": · Analizar la expresión de genes individuales; · Analizar la expresión de las familias y grupos de genes; · Compare patrones de expresión y valores atípicos; · Acceda directamente a otras bases de datos genómicas para genes de interés. Nota: Maexplorer se publica bajo la licencia pública de Mozilla 1.1 (MPL 1.1).

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