Miciciero Herramienta para mejorar la anotación del genoma de C. elegans usando el aprendizaje de la máquina
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Herramienta para mejorar la anotación del genoma C. elegans usando el aprendizaje de la máquina. Capacitación La herramienta de Micicer implicará resolver un problema de optimización lineal relativamente grande, implementado en MATLAB utilizando el paquete de optimización CPLEX. El ISPICER se basa en los scripts de Python que llaman métodos implementados en C ++ para predecir los sitios de empalme utilizando máquinas de soporte vectoriales y programación dinámica para la predicción de formulario de empalme. Estas rutinas son parte de la caja de herramientas Shogun gratuitamente disponible para el aprendizaje de kernel a gran escala. Requisitos: · Shogun 0.6.2 o posterior · Python

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