Oligocheck
Descargar ahora

Oligocheck Clasificación y resumen

Oligocheck Etiquetas

cheque calidad Investigacion Compruebe la calidad calidad de la sonda filogenética corrector de calidad

Oligocheck Descripción

Software para verificar la calidad de las sondas filogenéticas y los conjuntos de imprimaciones. Oligocheck es un software de código abierto para verificar la calidad de las sondas filogenéticas y los imprimadores. La capacidad de los conjuntos de cebadores de ácido nucleico y las sondas para unirse exclusivamente a la secuencia de ácido nucleico correcto es fundamental para la focalización precisa de los grupos filogenéticos específicos. Dicha especificidad depende en gran medida de la singularidad de la secuencia de ácido nucleico, estos oligonucleótidos se dirigen. Cuanto más única sea la región, más robusta, el imprimador establecido o la sonda se reduzca solo al objetivo previsto, incluso si las variaciones en la temperatura de recocido y otros parámetros bioquímicamente relevantes resultan en la unión de oligonucleótidos con éxito con las diferencias de la base con una o más diferencias de base. Por lo tanto, un conjunto de cebador o una sonda robusta se puede ver como uno que recubra exclusivamente a su objetivo previsto, incluso cuando se permiten uno o más desajustes .Eligocheck está diseñado para evaluar esta robustez, al evaluar un conjunto filogénico establecido o de la sonda como el número de Los desajustes basados ​​con la secuencia de objetivos potenciales aumentan. El usuario suministra un conjunto de cebadores o una sonda para verificar, junto con una base de datos de secuencias de ácido nucleico. Oligocheck Cheques el conjunto de cebadores o la sonda contra cada registro relevante en la base de datos y señala si se producen coincidencias con un número creciente de desajustes de base permitidos. El análisis resultante se muestra en una forma gráfica junto con los datos de registro de secuencia. Requisitos: · Java 1.4 o posterior

Oligocheck Software relacionado