Oligofaktory se

OLIGOFAKTORYSE - diseño oligonucleótido hecho simple
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Oligofaktory se Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Colas Schretter
  • Sitio web del editor:
  • http://homepages.ulb.ac.be/~cschrett/oligofaktory/
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X 10.4 or later
  • Tamaño del archivo:
  • 1.2 MB

Oligofaktory se Etiquetas


Oligofaktory se Descripción

Oligofaktororyse - Diseño de oligonucleótidos Hecho simple OligoFaktory Standalone Edition es un conjunto integrado de herramientas bioinformáticas para el diseño de oligonucleótidos largos para micro-matriz, de par de imprimación para PCR, de SIRNA y más. La interfaz de usuario enfatiza la inquietud y está dirigida a ayudar a los investigadores para un diseño sin dolor, rápido, automatizado y confiable. Una interfaz de detalle maestro permite a los usuarios ingresar a sus secuencias y regiones relacionadas. Los usuarios pueden cortar y pegar la consulta ADN en la vista del editor, o pueden usar el elemento del menú Archivo> Importar para importar archivos FASTA.SEVERAL Design iteraciones se pueden aplicar, utilizando cinco acciones complementarias: · La acción de diseño de Oligos permite la acción automatizada. Diseño de oligonucleótidos largos específicos en un número arbitrario de ORF (por ejemplo, para el desarrollo de microarrays de ADN). · La acción de los cebadores de diseño permite el diseño automatizado de pares de cebadores PCR específicos en un número arbitrario de regiones. · La acción de Sirnas de diseño permite Diseño de SIRNA óptimo de 19bp con el método descrito en el diseño racional de SIRNA para la interferencia de ARN, A. Reynolds et al. Nature Biotechnology, 2004, Vol 22, 326-330. · La acción de repetición de detección identifica todas las repeticiones y microsatelitas en las restricciones especificadas por el usuario. · La acción de combinación de regiones fusiona las regiones que están demasiado cerca para permitir el diseño de pares de cebadores específicos. Si es necesario. Puede elegir una especie contra la cual se evaluará la sensibilidad y la especificidad de oligonucleótidos. · Usted podrá visualizar sus resultados en tres sabores diferentes: · La vista de jerarquía es una lista larga que muestra gráficos de barras de ubicación relativa de consultas y resultados. · La vista de lista es una lista corta que enfatiza los resultados de las hojas, mientras oculta la información de las ubicaciones. · La vista de estadísticas resume los resultados con los gráficos que muestran las distribuciones de las características principales. Toda la información detallada sobre Heterodimer, horquilla, sensibilidad, homodímero y especificidad se obtiene haciendo clic en el Secuencia de oligonucleótidos. Puede exportar resultados a FASTA o un archivo delimitado por comas (CSV), legible por la mayoría de los programas de hoja de cálculo, como un s Microsoft Excel. También puede exportar la vista actual a un archivo web compatible con Safari. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · La apariencia y la sensación de la interfaz de usuario y los comportamientos de deshacer / rehacer se mejoran.


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