Palma ARNm a alineaciones de genoma utilizando grandes algoritmos de margen
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ARNm a alineaciones de genoma utilizando grandes algoritmos de margen Palma alinea dos secuencias genómicas de forma óptima de acuerdo con su algoritmo subyacente y parámetros capacitados. La guión principal de Python toma dos archivos FASTA que contienen el objetivo (por ejemplo, una secuencia de ADN, parte del genoma) y las secuencias de consulta (por ejemplo, un cDNA o secuencia de EST). Palma crea una alineación con programación dinámica (escrita en C ++) y devuelve la alineación en un formato similar a PSL. Los algoritmos serán los que calcularán alineaciones locales óptimas, por lo que si no se ha encontrado ninguna alineación, ya que ninguna alineación tiene una puntuación de alineación suficientemente alta. Requisitos: · Shogun · Python

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