Pirxo

Ver datos moleculares con esta herramienta
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Pirxo Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • BSD
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Sargis Dallakyan
  • Sitio web del editor:
  • http://mgltools.scripps.edu/Members/sargis
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X
  • Tamaño del archivo:
  • 118.9 MB

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Pirxo Descripción

Ver datos moleculares con esta herramienta. PYRX es una aplicación de detección virtual fácil de usar especialmente diseñada especialmente para el descubrimiento computacional de medicamentos que se puede utilizar para detectar las bibliotecas de compuestos contra posibles objetivos de medicamentos. PYRX permite a los químicos medicinales ejecutar la selección virtual forman cualquier plataforma y ayude a los usuarios en cada paso de este proceso, desde la preparación de datos hasta el envío y el análisis de los resultados. Si bien es cierto que no hay un botón mágico en el proceso de descubrimiento de fármacos, PYRX incluye asistente de acoplamiento con una interfaz de usuario fácil de usar, lo que lo convierte en una herramienta valiosa para el diseño de medicamentos asistido por computadora. PYRX también incluye funcionalidad similar a la hoja de cálculo química y un potente motor de visualización que son esenciales para el diseño racional de medicamentos. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Agregado Guardar como herramienta de valores separados por comas (CSV) para tablas de base de datos. · Se agregó la función de trazado para las tablas de la base de datos. Se puede acceder a esta característica a través de un botón de la barra de herramientas en la pestaña Tablas. De forma predeterminada, se abre el cuadro de diálogo de trazado de la tabla donde se muestra una parcela de barra de energía de unión contra ligando (índice). Si tiene PUBCHEM BIOASAY, que se abre utilizando el botón Abrir CVS, este widget también verificará si hay una columna de resultados en esa tabla, y de ser así, coloreará las barras correspondientes al rojo "activo", el rojo y las barras correspondientes a "inactivo" azul. . · Cambio campo de fuerza predeterminado para la minimización de energía de Babel abierto de UFF a MMFF94. · Se cambió de forma predeterminada para el número máximo de evaluaciones de energía (parámetro de algoritmo genérico en AutoDoCH) a partir de medio (GA_NUM_EVALS = 2500000) a corto (GA_NUM_EVALS = 250000). · Añadido AutoDOCK PBS TRABAJO DE PRESENTACIÓN DE PRESENTACIÓN DE PRESIONES DE PRENSIÓN. · Se corrigió un error que estaba causando problemas al mostrar las superficies moleculares para las conformaciones acopladas. · Se agregó un cuadro de diálogo para seleccionar conformación alternativa al realizar un archivo de macromolécula (PDBQT) para AutoDock. · Habilitado el agente de calidad de entusión que se puede usar para obtener informes de errores y comentarios de un usuario. · Opción de cancelación añadida para los servicios web de AutoGRID. · Implementó residuos flexibles para autodock. Esta función puede acceder seleccionando residuos en Navigator-> Moléculas y haciendo clic derecho en ellas. Seleccione AutoDock -> Residuos flexibles para crear una carpeta _flex en Navigator -> AUTODOCK -> Macromoléculas con receptor PDBQT y FLEX.PDBQT. Todo el acoplamiento a este receptor se realiza con este residuo flexible (s). · Python actualizado a la versión 2.6 y ETS a 3.4.0.


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