Puma Una herramienta para el análisis bayesiano de la adecuación modelo particionada
Descargar ahora

Puma Clasificación y resumen

Puma Etiquetas

analizar análisis bayesiano Análisis bayesiano

Puma Descripción

PUMA es una aplicación basada en Java que evalúa la adecuación de los modelos filogenéticos de evolución de secuencia en un contexto bayesiano utilizando una simulación predictiva posterior. Se ha demostrado que la precisión de la inferencia filogenética bayesiana que utiliza los datos moleculares depende del uso de modelos adecuados de evolución de la secuencia. Mientras que elegir el mejor modelo disponible de un grupo de alternativas se ha convertido en una práctica estándar en filogenética estadística, la evaluación de la adecuación del modelo elegido es rara. Los programas para la inferencia filogenética bayesiana han comenzado recientemente a implementar modelos de evolución de secuencia que representan la heterogeneidad en el proceso en todos los sitios, pero no existe ningún programa para evaluar la adecuación de estos modelos. PUMA implementa un enfoque de simulación predictiva posterior para evaluar la adecuación de los modelos particionados, no particionados y de mezcla de evolución de la secuencia de ADN en un contexto bayesiano. La evaluación de la adecuación del modelo permite que los filogenéticos empíricos tengan la confianza adecuada en sus resultados y guían los esfuerzos de los filogenéticos teóricos para mejorar los modelos de evolución de la secuencia.

Puma Software relacionado