Reducir Aplicación gratuita para agregar hidrogenas a un archivo de estructura molecular de un banco de datos de proteínas (PDB)
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Aplicación gratuita para agregar hidrógenos a un archivo de estructura molecular de un banco de datos de proteínas (PDB) Reducir es una aplicación gratuita para agregar hidrogenas a un archivo de estructura molecular de un banco de datos de proteínas (PDB). Las hidrogenas se agregan en la geometría estandarizada con la optimización de las orientaciones de OH, NH3, SH, ASN, METLS, y se pueden procesar las proteínas de sidechain de GLN y sus anillos. Los grupos HET también se pueden procesar siempre que se proporcione la conectividad Atom. Una versión ligeramente modificada de la tabla de conectividad publicada por el PDB está disponible a continuación. Tenga en cuenta que el diccionario HET está disponible en dos "sabores" - Nuevo y viejo. Cuál usar depende de qué tipo de PDB reducido desea como salida.

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