SPDBV UI diseñado para analizar varias proteínas al mismo tiempo
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SPDBV Descripción

UI diseñado para analizar varias proteínas al mismo tiempo Swiss-PDBViewer (SPDBV), aka deepview, es una aplicación que proporciona una interfaz fácil de usar que permite analizar varias proteínas al mismo tiempo. Las proteínas se pueden superponer para deducir alineaciones estructurales y comparar sus sitios activos o cualquier otra parte relevante. Las mutaciones de aminoácidos, los enlaces H, los ángulos y las distancias entre los átomos son fáciles de obtener gracias a la intuición de la interfaz gráfica y del menú. Además, Swiss-PDBViewer está estrechamente vinculado a un modelo suizo, un servidor de modelado de homología automatizado desarrollado dentro del Instituto Suizo de Bioinformática (SIB) En colaboración entre GlaxoSmithKline RD y el grupo bioinformático estructural en Biozentrum en Basilea. Trabajar con estos dos programas reduce en gran medida la cantidad de trabajo necesario para generar modelos, ya que es posible pasar una secuencia primaria de proteína en una plantilla 3D y obtenga una retroalimentación inmediata de la forma en que la proteína roscada será aceptada por la estructura de referencia antes de enviar una solicitud para construir bucles que faltan y refinen el embalaje de Sidechain.swiss-PDBViewer también puede leer los mapas de densidad de electrones y ofrece varias herramientas para construir en La densidad. Además, se incluyen varias herramientas de modelado y se pueden generar archivos de comando para los paquetes de minimización de energía populares. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · El átomo de la timina C6 ahora está cargada correctamente. · Se corrigió el bucle sin fin de salida de rayos POV en la versión de la PC. · El accidente ocasional mientras se ahorra archivos PDB (como 2i37) en la PC se ha solucionado. · Actualizado la dirección del servidor de mapas de densidad de electrones de UPPSALA.

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