Seqdiverse

Una herramienta que mide la diversidad posicional de las lecturas de secuenciación de próxima generación
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Seqdiverse Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • MIT License
  • Nombre del editor:
  • Justin T. Brown
  • Sitio web del editor:
  • http://code.google.com/u/103569611691585664933/
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X
  • Tamaño del archivo:
  • 1.7 MB

Seqdiverse Etiquetas


Seqdiverse Descripción

Un paso importante en la tubería de análisis de secuenciación de próxima generación es determinar la calidad de las secuencias Fastq. Los artefactos de secuenciación, tales (como la lectura del adaptador, la cebada no tan aleatoria, las secuencias de barras y los sesgos de PCR) pueden afectar la capacidad de uno para discernir la naturaleza verdadera de los datos. Además, es posible que se necesiten pasos de pre-alineación, como el recorte para mejorar la sensibilidad de la alineación. SeqDiverse es una aplicación gratuita y de código abierto que puede mostrar medidas de diversidad para la secuenciación de datos que pueden ayudar a identificar estos artefactos. Las instrucciones detalladas sobre cómo instalar y usar la utilidad SEQDiverse en su Mac están disponibles aquí.SEQDIVERSE es una utilidad multiplataforma capaz de ejecutarse en cualquier sistema operativo que viene con el soporte de Java (por ejemplo, Mac OS X, Windows, Linux).


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