Sesion Una herramienta que proporciona control de calidad sobre conjuntos de datos RNA-SEQ
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arn transcriptoma

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La secuenciación del transcriptoma profundo (RNA-SEC) proporciona información masiva y valiosa sobre elementos funcionales en el genoma. Usando los datos de RNA-SEQ, las personas pueden perfilar el cambio de expresión génica, interrogar a los eventos alternativos de empalme, descubrir nuevas regiones transcritas, detectar las transcripciones aberrantes (como las fusiones genéticas) y las variantes de codificación, etc., idealmente, la secuenciación del transcriptoma debe identificar y cuantificar directamente Todas las especies de ARN, pequeña o grande, baja o alta abundancia. Sin embargo, RNA-SEC es un proceso complicado y multiespe que involucra la preparación de la muestra, la amplificación, la fragmentación, la purificación y la secuenciación. Una sola operación inadecuada resultaría en datos sesgados o incluso inutilizables. Por lo tanto, siempre es una buena práctica verificar la calidad de sus datos de ARN-SEQ antes de continuar con cualquier dirección indicada anteriormente. Ever-Seq es un paquete gratuito y de código abierto (evaluar el experimento de RNA-SEC) a los conjuntos de datos ARN-SEQ de control de calidad integral. Ever-Seq es multiplataforma y funciona en Mac OS X, Windows y Linux. Las instrucciones de correo electrónico sobre cómo instalar y usar la utilidad Ever-SEQ en su Mac están disponibles aquí.

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