Sistemas biology workbench Libre, código abierto y marco simple para la aplicación Interr-Communications
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Sistemas biology workbench Clasificación y resumen

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app Marco de comunicación comunicación comunicar comunicación de aplicaciones aplicación de intercomunicación

Sistemas biology workbench Descripción

Free, Open Source y Simple Framework para la aplicación Inter-Communications Systems Biology Workbench (SBW), es un marco de software que permite componentes heterogéneos de la aplicación, escritos en diversos lenguajes de programación y se ejecutan en diferentes plataformas, para comunicarse y usar las capacidades de cada uno a través de un sistema de mensaje codificado binario rápido. El objetivo de Workbench de Systems Biology es crear una infraestructura de software de código abierto de alto rendimiento y de alto rendimiento que sea fácil de implementar y comprender. SBW permite aplicaciones (potencialmente ejecutándose en computadoras separadas, distribuidas) para comunicarse a través de un protocolo de red simple. Las interfaces al sistema están encapsuladas en las bibliotecas del lado del cliente que proporcionamos para diferentes lenguajes de programación. Consta de dos componentes, un corredor para enrutar mensajes y módulos que envían y reciben mensajes. Todas las conexiones entre módulos y un corredor son a través de sockets TCP / IP estándar. Todos los mensajes se transmiten en un formato binario para el máximo rendimiento. Si necesita enviar un mensaje entre dos computadoras diferentes, luego los mensajes se envían primero al corredor en la máquina remota, esto, a su vez, roza el mensaje al Módulo Remoto correcto. Modules Puede escrito en una variedad de idiomas, incluyendo, C / C, Java, Perl, Python, Delphi y Matlab.Note: SBW se libera bajo la licencia BSD. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: Análisis de conservación: · Reescribió la herramienta de análisis de conservación, produciendo mejor rendimiento y confiabilidad. Módulo de clapack: · Reescribió el módulo de Clapack para un mejor rendimiento y confiabilidad. C # Inspector: · Permitir ingresar matrices complejas especificando números complejos utilizando el formato: '(' '+' ')' · Mejoras con el enrutamiento de excepciones y la optimización de la UI. Estructanálisis ui: · Correcciones menores para tratar con SBML inválido JARNAC: · Región fija de manejo de números. · Permitir la carga de SBML directamente en el editor con la traducción automática de JARNAC. · Función agregada de rebanada (Matrix, BownIndex, SuperNIndex) para hacer que lemente extienda las filas de una matriz. · Se agregó la función de hora de tiempo (M, TimeTime, Upper Time), esto se agregó para admitir las nuevas funciones de simulación estocástica y le permite a un usuario extraer datos de una simulación estocástica entre dos puntos de tiempo. Los datos deben generarse a partir de cualquiera de las llamadas de simulación de GillXXX. La función asume que la primera columna de los datos es la variable de tiempo. · Señaló una serie de nuevas funciones para llamar al módulo GillDM en SBW. Esto permite · Acceso a un simulador estocástico más rápido y totalmente probado, los nuevos métodos incluyen: gillloadsbml (SBMLSTR): GILLLOADSBML (P.XML) GillSimulate (Tiempo de inicio, Tiempo de tiempo, periodización): PERÍODO DE PREJO TIEMPO PARA OBTENER TODOS LOS DATOS GILLSIMATEONGRIDE (Tiempo de inicio, Tiempo final. Redes / GillsimulatemeAnonGrid (Tiempo de inicio, Tiempo de inicio, Redes, Pobladuras): simula una población de carreras en una cuadrícula y devuelve la trayectoria media. GillsimulatemeAnandsDonGrid (Tiempo de inicio, Tiempo final, Piedrase, Poblección): Igual que la anterior, excepto que también devuelve la desviación estándar a lo largo del tiempo para cada especie. Setseed (semilla): Establezca la semilla de números aleatorios, permite repetirse exactamente las ejecuciones. (La semilla debe ser un valor entero). · Error fijo para acceder al menú SBW. · Función Añadida PDF (M). Esto calificará la función de densidad de probabilidad para el vector de datos suministrados en la función. · Agregado el gráfico (M) Esto es lo mismo que el gráfico, pero en su lugar, parece un histograma en lugar de un gráfico de línea.

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