Tina Herramienta Una caja de herramientas para explorar vías en sistemas bioquímicos en estado estable
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simular modelado bioinformática Biología Molecular Redes de petri sistema biológico

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Una caja de herramientas para explorar vías en sistemas bioquímicos en estado estable Combinando enfoques experimentales y teóricos para iluminar el funcionamiento de los procesos moleculares en la célula es un objetivo principal en la biología de los sistemas. El modelado teórico de los sistemas biológicos en particular será cada vez más importante para reducir los experimentos de laboratorio húmedos para el hallazgo objetivo. Basado en modelos de netos de Petri cualitativos, un conjunto mínimo de vías básicas en estado estable, las invariantes de transición (T-invariantes) o modos elementales , respectivamente, se puede calcular. En el caso de redes complejas y grandes, el número de t-invariantes aumenta exponencialmente. Por lo tanto, se han desarrollado nuevos conceptos para la descomposición de la red adicional en vías biológicamente significativas, como los conjuntos de MCT, T-Clusters y Mauritius Maps. Para esta razón, el equipo de Tina Tool ha desarrollado una herramienta de software que compila todos estos conceptos que proporcionan un usuario Interfaz amigable y varias interfaces a las Nets Petri y las normas de biología de los sistemas. Requisitos: · Java

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