Vmtk que se puede utilizar para la reconstrucción 3D de los vasos sanguíneos
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generar 3d reconstruir Reconstrucción 3D Generación de malla vaso sanguíneo

Vmtk Descripción

Programa que se puede utilizar para la reconstrucción 3D de los vasos sanguíneos. VMTK está compuesto por bibliotecas y herramientas para la reconstrucción 3D, el análisis geométrico, la generación de malla y el análisis de datos de superficie en el modelado de vesmos sanguíneos basados ​​en imágenes. Aquí hay algunas características clave de "VMTK": Segmentación de segmentos vasculares (u otras estructuras anatómicas) de imágenes médicas: · Nivel 3D basado en degradados establece la segmentación. Una nueva modalidad de computación de gradiente basada en las diferencias finitas en contra del viento permite la segmentación de recipientes pequeños (hasta 1.2 píxeles / diámetro). · Nivel interactivo establece la inicialización según el método de marcha rápida. Esto incluye un método nuevo para seleccionar un segmento vascular comprendido entre dos puntos que ignoran automáticamente las ramas laterales, sin parámetros involucrados. Segmentar un tracto vascular complejo se reduce a seleccionar los puntos finales de una rama, dejando que los conjuntos de niveles se sientan atraídos por los picos de gradiente con el término de advección único encendido, repitiendo la operación para todas las ramas y fusionando todo en un solo modelo. Análisis geométrico y procesamiento de datos superficiales de modelos 3D de vasos sanguíneos (y objetos tubulares en general) ((los algoritmos clave se han publicado en revistas de imágenes médicas. Puede encontrar una referencia completa a las publicaciones en las páginas de DAVID STEINMAN Y LUCA ANTIGA): · Compute las líneas centrales y un radio de esfera inscrito máximo de las estructuras tubulares de ramificación dadas su representación de la superficie poligonal. · Modelos de superficie divididos en sus ramas constitutivas basadas en la geometría de la línea central. · Compute las cantidades geométricas basadas en la línea central (como ángulos de bifurcación, planaridad, simetría, curvatura de rama, tortuosidad) y cantidades geométricas a base de superficie (como la distancia a las líneas centrales, la curvatura de la superficie, la desviación de la tangencia a las esferas inscritas máximas) · Ramas de mapa robusta a un espacio paramétrico rectangular. · Generar parches rectangulares basados ​​en la asignación paramétrica para el análisis estadístico de datos geométricos y CFD sobre poblaciones. Scripts, E / S Herramientas y algoritmos simples para trabajar fácilmente con imágenes y mallas: · Lea y escriba una serie de formatos de malla de imagen, superficie y volumen. Incluye un lector de la serie DICOM con capacidades de volteo automático, lector de formato de malla de Netgen, escritor de formato de malla de Libmesh XDA, envoltorios de generador de malla de Tetgen, lector de formato de malla FIDAP FDNEUT y escritor y un generador de archivos de entrada NewTeTRTR · Mostrar imágenes y mallas. · Incapsule varias clases de VTK y las pone a disposición de los scripts pipiales, por ejemplo. Cubos de marcha, suavizado de superficie, recorte, cálculo normal, (conectividad, subdivisión, distancia entre superficies, registro de ICP) · Agregue extensiones cilíndricas a los límites del modelo de superficie como un paso de preprocesamiento para las simulaciones CFD. · Generar capas límite de elementos prismáticos con un grosor variable para CFD ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Error fijo en la generación de extensión de flujo. · Recuperación de superficies mejoradas · Problemas fijos de compilación de Windows · Problemas de compilación fijos de 64 bits. · Finalmente (gracias a la gran contribución inicial de Michalis y la ayuda posterior de HUGO y JOPPE), la exportación fluida a los archivos MSH funciona correctamente y preserva los indicadores de límites correctamente. Esto también permite usar mallas VMTK con OpenFOAM. · Los escritores de malla de Dolfin y Lifev fijaron y mejoraron. · Interpolación de funciones de base radial añadida · Se agregó un modelo eficiente de tubos de líneas centrales + radio. · Incluye nuevos métodos de mejora de buques. · Algoritmo de análisis de red vascular rápida (ver mi tesis de doctorado) portado a VMTK · Proyección cuadrática de mallas lineales ahora hace una verificación completa para jacobianos negativos . · Fusión de la línea central agregada · Extracción agregada de perfiles de bifurcación. · Script añadido de tetraedralización para mallas mixtas

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