Xcellerador Paquete de Mathematica para modelado biológico
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Paquete Mathematica para modelado biológico. Xcellerator es un paquete de código abierto y gratuito para Mathematica, diseñado para ayudar a modelar biológicos a través de la conversión automatizada de reacciones químicas a las Odas. Xcellerator está compatible con la sintaxis de reacción definida en el celular, pero utiliza un algoritmo completamente diferente para realizar la traducción. Nota: Xcellerator tiene licencia y se distribuye según los términos de la Biblioteca GNU o la Licencia Pública General (LGPL). Aquí hay algunas características clave de "Xcellerator": · Extensibilidad de tamaño de modelo: traducción de reacción más rápida (hasta 100 veces más rápido que el celular) · Extensión de software: los puntos de entrada directos se limitan a los necesarios para el usuario para reducir significativamente la posibilidad de una colisión global del identificador · Extensión de reacción: el usuario puede definir nuevas reacciones "en la marcha" · Modelos estocásticos utilizando la SSA de Gillespie. · Extensión de modelo: Soporte de entrada y salida SBML (proporcionado por MathSBML) · Simulación de eventos discretos. · Reglas de asignación y velocidad: capacidad para agregar restricciones adicionales a un modelo como reglas. · Modelos multi-celulares / multi-compartimento Requisitos: · Mathematica ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: · Fijar la trazado de variables encapsuladas como el diamante .

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