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jmotu Clasificación y resumen
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- Licencia:
- Freeware
- Nombre del editor:
- Mark Blaxter
- Sitio web del editor:
- http://www.nematodes.org/
- Sistemas operativos:
- Mac OS X
- Tamaño del archivo:
- 7.5 MB
jmotu Etiquetas
jmotu Descripción
Software para agrupar datos de secuencia de ADN de código de barras en unidades taxonómicas operativas moleculares (MOTU) JMOTU es un paquete de software gratuito y fácil de usar para agrupar los datos de secuencia de ADN de código de barras en unidades taxonómicas operativas moleculares (MOTU). JMOTU puede procesar grandes conjuntos de datos y utiliza una serie de pasos de filtrado para minimizar el número de alineaciones globales exactas que deben realizarse. Al calcular las distancias de pares, JMOTU ignora las brechas y cuenta solo las coincidencias de nucleótidos, lo que hace que sea relativamente robusto para las secuencias de errores causadas por las carreras de homopolímero. La agrupación se lleva a cabo utilizando un algoritmo codicioso que no depende de la orden de la secuencia de entrada. JMOTU se ha probado en conjuntos de datos crudos de alrededor de 50,000 secuencias de entrada, y pueden agrupar conjuntos de datos más grandes mediante la presentación de preclusiones de los subconjuntos de datos antes de combinarlos para un análisis global.
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