Análisis de señalización SAVI y visualización. Analice y visualice las señales celulares y las redes hechas de componentes celulares.
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Análisis de señalización SAVI y visualización. Clasificación y resumen

Análisis de señalización SAVI y visualización. Etiquetas

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Análisis de señalización SAVI y visualización. Descripción

Visualización de las interacciones proteínas-proteínas y ligando-proteínas como gráficos (redes), donde las biomoléculas se representan como nodos y sus interacciones están representadas como enlaces, es un enfoque prometedor para integrar los resultados experimentales de diferentes fuentes para lograr una comprensión sistemática de los mecanismos moleculares que impulsan el fenotipo celular. . La aparición de redes de señalización a gran escala proporciona una oportunidad para el análisis estadístico topológico, mientras que la visualización de tales redes representa un desafío. SAVI implementa métodos estándar para calcular el agrupamiento, la distribución de conectividad y la detección, así como la visualización, de los motivos de la red. Además, Savi genera un sitio web completo de los conjuntos de datos de red en formato de texto. SAVI contiene una herramienta llamada PathwayGenerator. Esta herramienta crea mapas de conexión como páginas web de tablas grandes que describen las interacciones de señalización celular. SAVI también puede crear redes de listas de nombres de genes / proteínas. La versión 2.5 puede incluir actualizaciones, mejoras o correcciones de errores no especificadas.

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