Bowtie para Linux

Bowtie para Linux es un alineador de lectura ultrarrápido y eficiente en memoria de memoria
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Bowtie para Linux Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Freeware
  • Nombre del editor:
  • Ben Langmead
  • Sitio web del editor:
  • Sistemas operativos:
  • Linux
  • Tamaño del archivo:
  • 13.40MB

Bowtie para Linux Etiquetas


Bowtie para Linux Descripción

Anuncio publicitario Bowtie for Linux es un software de educación y educación desarrollado por Ben Langmead. Después de nuestra prueba y prueba, se demuestra que el software sea oficial, seguro y gratuito. Aquí está la descripción oficial de Bowtie para Linux: Editar por Bowtie para Linux es un alineador de lectura breves e ultrarrápido y eficiente en memoria. Alinea las secuencias cortas de ADN (lecturas) al genoma humano a una tasa de 25 millones de lecturas por hora en una estación de trabajo típica con 2 gigabytes de memoria. Bowtie indexa el genoma con un índice de madrigueras para mantener la huella de la memoria pequeña: 1.3 GB para el genoma humano. Admite las políticas de alineación equivalente a MAQ y SOAP, pero es mucho más rápido: aproximadamente 35X más rápido que MAQ y más de 350X más rápido que el jabón al alinear al genoma humano. Características: Se corrigieron todos los problemas conocidos con las opciones de --unfa / - FLQ: Ahora trabajan correctamente con múltiples hilos. Problema fijo donde la secuencia y los quienes se invirtieron a veces. Se solucionaron otros problemas que causan la omisión espuria de lecturas no alineadas. Se agregaron: las opciones de MAXFA / - MAXFQ, de modo que las lecturas que no se alinean debido al límite -M se pueden ver por separado de las lecturas que no se alinean en absoluto. La salida de alineación ahora está garantizada para ser "determinista", incluso cuando se usan múltiples hilos. I.E., dada las mismas lecturas de entrada (en cualquier orden) y el mismo, Bowtie producirá las mismas alineaciones cada vez que se ejecuta, aunque no necesariamente en el mismo orden. Esto no se mantiene en diferentes versiones de Bowtie. Múltiples correcciones de errores.


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