clustalw es una herramienta práctica, fácil de usar, especialmente diseñada para ayudarlo con múltiples alineación de ácidos nucleicos y secuencias de proteínas. Entrada de secuencia: todas las secuencias deben estar en 1 archivo, uno tras otro. 7 Los formatos se reconocen automáticamente: NBRF-PIR, EMBL-SWISSPROT, PEARSON (FASTA), Clustal (* .aln), GCG-MSF (PILEUT), GCG9-RSF y el archivo plano GDE. Todos los caracteres no alfabéticos (espacios, dígitos, signos de puntuación) se ignoran, excepto "-" que se usa para indicar un hueco ("" en MSF-RSF).
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