Dnavassist Un programa para la edición y análisis de datos de secuencia de biología molecular
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Lea el documento en DNASSIST en bioinformática VER EL CAPÍTULO DE LIBRO EN DNASSIST DN AYUDA Una interfaz intuitiva y única dentro de la cual los archivos de secuencia son Se muestra, editó y analizó. Varias ventanas del editor pueden estar abiertas, y el usuario puede funcionar en cualquiera de estas ventanas simplemente trayendo a la cima. La ventana del editor es similar a un procesador de textos. La ventana, y las secuencias se pueden ingresar desde el teclado, seleccionado con el puntero del mouse, copiado, cortado y pegado hacia y desde el Portapapeles, arrastre y caído dentro de la misma o con otro editor Windows, y búsquedas de texto realizadas. Las ventanas también pueden ser Cascado, embaldosado o minimizado. El usuario puede personalizar la pantalla en Editor Windows seleccionando la fuente, tamaño de fuente y longitud de la línea. A La secuencia se analiza simplemente trayendo una ventana del editor a la parte superior, y seleccionando el análisis requerido desde el menú. Todos los análisis pueden También se realiza en una región seleccionada de la secuencia en un editor. ventana. Hacer clic derecho en el mouse proporcionará un contexto sensible al contexto menú emergente. Esto le da al usuario un conveniente atajo para la mayoría del menú elementos. ADN SSIST también proporciona una barra de velocidad con botones Representando acciones comunes. Los análisis disponibles en DN ASISTE incluye: la conversión de una secuencia de ADN entre la circular y formas lineales la conversión de ADN a un ARN o una secuencia de proteínas la conversión del ARN a un ADN o una secuencia de proteínas traduciendo una secuencia de ADN a la secuencia de aminoácidos en uno, tres o los seis marcos Localización de marcos de lectura abiertos (ORF) en una secuencia de ADN Localización de patrones de secuencia específicos en una secuencia (esto permite comodines, desajustes y huecos) realizando un análisis de enzimas de restricción con un conjunto definido de enzimas realizando un análisis de promotor de ADN con especificado factores de transcripción Localización de señales de posicionamiento de nucleosomas fuertes en ADN realizando múltiples alineaciones de ADN, ARN o proteínas Obtención del peso molecular de un ácido nucleico o proteína Obtención de la temperatura de fusión de un oligonucleótido. calculando el PI de una proteína Cálculo del perfil hidrofílico, hidrofóbico o antigénico de una proteína Obtención del coeficiente de absorción molar y E0.1% de un ácido nucleico o una proteína. obteniendo el nucleótido o la composición de aminoácidos de un Ácido nucleico o proteína DN ASSIST trae todos estos características juntas en un Windows® más integrado solicitud. Esto le da al usuario la libertad de trabajar en el Ieae intuitiva de DN Ayudar como en un procesamiento de palabras medio ambiente, y tener una batería extensa y poderosa de Características analíticas Un clic del ratón de distancia. El resultado de un El análisis se muestra en una ventana de resultados y se puede imprimir, guardar para disco o copiado y pegado en aplicaciones de terceros. Guardado o Los resultados copiados conservan el formato en el que se mostraron. El El usuario puede seleccionar desde una amplia gama de opciones de formato. Esta incluye la visualización de secuencias como líneas continuas de texto o como bloques de texto. Se puede mostrar una o ambas hebras de una secuencia de ADN. La posición de los números de secuencia relativos a la secuencia puede También se especifique, al igual que la cara y el tamaño de la fuente. El usuario también puede Especifique los colores de las casillas utilizadas para indicar idénticas o conservadas. Aminoácidos en alineaciones múltiples. Es así posible personalizar DN Ayuda a la preferencia de cada usuario. La pantalla Las opciones de formato y las opciones de la ventana del editor se guardan en el Registro Cuando el usuario sale de DN Ayive . En un usuario múltiple Medio ambiente, estas configuraciones están asociadas con el nombre bajo el cual El usuario registró en Windows®. Esto permite a muchos usuarios usar DN Ayive en una sola computadora, donde cada usuario tendrá Preferencias personalizadas que no son cambiadas por las del otro. usuarios.

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