Dtscore Un algoritmo de reconstrucción de árbol de duplicación en tándem basado en la distancia
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Dtscore Clasificación y resumen

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Dtscore Descripción

La aplicación DTSCORE se desarrolló para ser un algoritmo de reconstrucción de árbol de duplicación en tándem a distancia. Se basa en un modelo de duplicación en tándem simple, que asume la recombinación desigual (cruce) como el único mecanismo de duplicación. Todo lo que toma como entrada es una matriz de distancia entre las copias. En esta matriz, las filas y las columnas deben ordenarse de la misma manera que las copias se ordenan en el lugar. DTSCORE se puede aplicar a conjuntos de datos relativamente grandes (más de cien copias). Las distancias se pueden calcular utilizando programas tales como DNADIST (secuencias de nucleótidos) o protDIST (secuencias de proteínas) del paquete PHYLIP. Las tasas heterogéneas de sustitución entre sitios pueden tratarse con el uso del método gamma, por ejemplo.

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