Genemir Búsqueda unificada de predicciones objetivo de MicroRNA de Mammalia.
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Genemir Descripción

La aplicación Genemir Software es una herramienta dirigida a biólogos y bioinformáficos que deseen encontrar predicciones y patrones de expresión en conjuntos de microRNA y genes. El programa funciona con el mouse y la predicción de objetivos humanos y los datos de expresión. Uno de los dos tipos de consulta se puede hacer seleccionando: · Uno o más microRNAS; · Uno o más genes o transcripciones; Para obtener respectivamente: · Una lista de genes previstos para ser dirigidos por los MicroRNA seleccionados; · Una lista de MicroRNAs predichas para apuntar a los genes seleccionados, así como una lista completa de genes dirigidos por esos microRNA. Cada una de estas consultas puede ser modificada por los filtros, que permiten al usuario seleccionar / deseleccionar cualquiera de los algoritmos de predicción y especificar los criterios de umbral que determinan el conjunto de microRNAS o genes devueltos. Los niveles de expresión de cada elemento en el conjunto de salida, así como la expresión promediada de todos los genes en ese conjunto, se pueden ver como un histograma. Los histogramas muestran los niveles de expresión a través de diferentes tejidos medidos en el conjunto de datos de GNF Symatlas (consulte la sección Tipos de datos), promediando los valores de expresión de cada stitreset que representa el mismo gen. Los datos de expresión externa también se pueden importar y ver de la misma manera (consulte la sección de Trend Tendencias de expresión y la sección de datos de expresión de carga). Cada elemento en el conjunto de resultados se puede vincular a los recursos web externos. Cualquier lista de genes de conformidad con el formato descrito en la sección Formato de archivo de conversión se puede procesar mediante la función de ID de conversión en uno de los cuatro identificadores de genes diferentes: Refseq, símbolo de genes, GNF / Affymetrix y Ensembl. ¡Dale a Genemir un intento de ver de qué es realmente capaz!

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