Gpmaw se pretende principalmente como una herramienta para el análisis espectrométrico en masa de las proteínas.
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Gpmaw Clasificación y resumen

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Gpmaw Descripción

El programa GPMAW está pensado principalmente como una herramienta para el análisis espectrométrico en masa de proteínas y péptidos. Sin embargo, se han incluido varias otras herramientas de bioinformática, por lo que el uso del programa se extiende mucho más allá del análisis de masa simple. Principales características: - Manejo de secuencias: importación de secuencias de varios formatos diferentes con Búsqueda de bases de datos directa en Entrez y en bases de datos locales (Formato FASTA y SWISS-PROT). Las secuencias se pueden guardar en archivos locales (bases de datos) para futuras referencias. Desde la ventana de secuencia se puede realizar una gran cantidad de acciones. Las secuencias se pueden exportar en formato FASTA (ya sea individualmente o todas las secuencias a la vez) para transferir fácilmente a otros programas. - Análisis en masa: la proteína se puede escindir por métodos automáticos (por ejemplo, una nomenclatura flexible para definir acciones de enzimas) o manualmente. Los péptidos se muestran con una serie de parámetros (varios valores en masa: índice MONO, AVE, Cargos - Índice de Bullbreese, índice HPLC, PI, CARGO) y se puede trabajar sobre (por ejemplo, una escisión nueva, reticulada). Las búsquedas de masas peptídicas se pueden realizar en cualquier base de datos local en formato FASTA. - Bioinformática: se pueden mostrar una serie de gráficos, hidrofobicidad, parcela de punto, predicción de estructura secundaria. Las búsquedas de explosión se pueden realizar en las bases de datos locales. Alineación múltiple utilizando Clustalw.

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