Nemo Estudia la historia de los conjuntos fenotípicos
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Nemo Clasificación y resumen

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extractor extraer Analizar mapa simulación simular simulador Estadísticas red Estadísticas de red mutación de la población población mostrar población población mundial estimación de la población Simulación de Genética Mendeliana Analizar la genética Mendelian. análisis genética mendeliana Genética emulada Genética de transmisión Laboratorio de Genética investigación genética genética Evolución de la genética de la población. distribución de la población algoritmo genética Población Genética Simulador Genética de la población Simular el cuello de botella de la población Cuello de botella demográfico simulador genético de poblaciones Simulador de población Dinámica poblacional monitor de población población autotetraploide Análisis de la genética de la transmisión. simular genética de la transmisión mezcla de población estimar los parámetros poblacionales Tamaño efectivo de la población estructura genética poblacional simular genética evolutiva simular la población simulación de población población demográfica población genética Definir grupos de población. grupo de población población haploide Estratificación de la población analizar la población análisis de la población Simulación de la población-genética.

Nemo Descripción

NEMO es un software de simulación genéticamente explícito genéticamente, y de simulación estocásticamente diseñada especialmente para estudiar la evolución del historial de vida / rasgos fenotípicos y la genética de la población en un marco flexible (meta) poblacional. NEMO implementa muchos eventos de ciclo de vida diferentes y rasgos evolucionables con una variedad de arquitecturas genéticas. La interacción de las especies entre un parásito y su anfitrión también se puede modelar (es decir, la incompatibilidad citoplasmica que induce endosimbiont: Wolbachia). Todo esto se enmarca dentro de un modelo de metapopulación flexible que permite capacidades de transporte específicas de parches, tasas de dispersión, tasas de extinción / recolección estocásticas y estocografía demográfica. Las poblaciones pueden modificarse dinámicamente durante una simulación, lo que permite cuellos de botella de la población, parche Fusion / Fisson, expansión de la población, etc. La selección espacialmente heterogénea en rasgos cuantitativos también se puede modelar. Principales características: rasgos: Marcadores neutros (microsatélites, SNP) mutaciones perjudiciales (con efectos fijos o aleatorios específicos de locus, y dominio) Rasgos cuantitativos (Nuevo en V2.2.0) (con loci cuantitativo pleiotrópico) Dispersión (expresión masculina y femenina específica) Wolbachia (incompatibilidad citoplásmica maternal-incompatibilidad con la incompatibilidad endosymbiont) Eventos del ciclo de vida: Cría (con promiscuidad, poligmia, monogamia, autocontrol y sistemas de apareamiento de clonación) Disperse (Modelo de la isla de la piscina / propagule migrante, los modelos de celosía 1D y 2D, etc.) Envejecimiento (con regulación de parches de techo) Selección de viabilidad (basada en mutaciones perjudiciales o selección de estabilización en rasgos cuantitativos) extinción / cosecha PATCH FUSION / FISSION Diseño de cruce (diseños Full-SIB / Half-SIB)

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