Ontomine Ontomine es un software de minería de datos utilizada para la minería molecular automatizada para la bioactividad, la toxicidad y la predicción de efectos secundarios. Ontomine se basa en propiedades determinadas experimentalmente de alrededor de 100.0
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Ontomine Descripción

Un software de minería de datos utilizada para la minería molecular automatizada para la bioactividad. Ontomine es un software de minería de datos utilizada para la minería molecular automatizada para la bioactividad, la toxicidad y la predicción de efectos secundarios. Ontomine se basa en propiedades determinadas experimentalmente de alrededor de 100.000 pequeñas moléculas pequeñas, recolectadas de bases de datos, enciclopedias y otra literatura seguidas de una curación de mano experta. Este conjunto de datos se formula en árboles jerárquicos compuestos por varios miles de clases de bioactividades, objetivos de fármacos, áreas terapéuticas, efectos adversos y toxicidades. Cada clase está representada por una huella digital para las moléculas relacionadas para sus propiedades moleculares, como la presencia / ausencia / recuentos de cadenas laterales / actividades químicas, estructuras de anillos, etc. Ontomine y comparación con otros métodos existentes. Otros enfoques de predicción de bioactividad actualmente utilizados pueden clasificarse en tres categorías: * Gráfico teórico y subestructura, descriptores químicos topológicos y fisicoquímicos. * Máximas subestructuras comunes, similitudes de huellas dactilares y métodos de aprendizaje automático. * Métodos de vecindario atom Sin embargo, estos métodos están actualmente limitados por factores como la dependencia de las métricas de la distancia, los recortes que no son representativos de la actividad, difíciles de construir modelos QSAR en varios niveles diferentes, por ejemplo. Objetivos de las drogas, procesos biológicos y área terapéutica, así como la interpretación de los resultados. Ontomine (EE. UU. Patentado) es alternativa a estos métodos, transformando la información estructural para moléculas químicamente, biológicamente o farmacológicamente relacionadas con un esquema jerárquico de conceptos y descriptores. Ontomine descubre patrones en el esquema relacionado y predice la actividad biológica, utilizando reglas inferidas al analizar los patrones. Una ventaja significativa de los algoritmos ontomine es que permiten saltar el scaffold, ya que el andamio central no se conserva cuando se descubre los patrones característicos de una actividad. Los patrones de ontomine representan condiciones "necesarias pero no suficientes" para la bioactividad independientemente de un andamio. El salto de andamio explícito se puede realizar generando isómeros constitucionales y seleccionando moléculas interesantes utilizando la base de reglas. Los resultados de Ontomine se presentan como simples patrones comprensibles representativos de la actividad. Además, las predicciones de ontomine son escalables a millones de moléculas. Además, los conjuntos de datos de ontomine curados se pueden agregar con conjuntos de datos internos de las actividades medidas de la molécula de las colecciones compuestas internas.

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