Oslay Matching de secuencia hecho fácil.
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Oslay Descripción

Oslay es una pieza práctica de software diseñada para usar sintenia entre secuencias correspondientes en un conjunto de destino y un conjunto de referencia para diseñar los contigs (o andamios) en el conjunto de destino. La herramienta proporciona una visualización interactiva del diseño computado y el resultado se puede importar a la herramienta de edición de ensamblaje conseje para admitir el diseño de pares de cebadores para el cierre de la brecha. Nota: Gratis para fines académicos. Principales características: Lee dos archivos FASTA (contigs de ensamblaje objetivo y secuencia de referencia / ensamblaje) y un archivo de explosión / nucleador es capaz de ordenar y ordenar ambos ejes simultáneamente si las secuencias de destino y de referencia son conjuntos sin terminar es aplicable a los genomas procendóticos y eucariotas tiene varias posibilidades para filtrar y adaptar datos como el recorte de extremos contiguos incomparables, filtrando golpes de explosión, ... Exporta vistas de resultados a varios formatos gráficos (.jpg, .gif, .eps, .png y .svg.) modifica o genera un nuevo archivo ACE importable directamente en CONSED PARA EL DISEÑO DE CIRADOR SIMPLIFICADO proporciona funcionalidad de zoom útil Facilita el análisis visual de las asambleas y metaditnes, por ejemplo. ocurrencias de recombinaciones o malassembly, respectivamente.

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