ProtseqFetch

Descargar secuencias de proteínas con facilidad.
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ProtseqFetch Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Nombre del editor:
  • pauleym
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
  • Tamaño del archivo:
  • 263 KB

ProtseqFetch Etiquetas


ProtseqFetch Descripción

ProtseqFetch es una pequeña aplicación basada en Java, especialmente diseñada para ayudarlo a descargar secuencias de proteínas de la base de datos NCBI o NR. Este software ofrece estas herramientas: Descargar datos de secuencia: Se proporcionan dos opciones para descargar los datos de secuencia de NCBI o el archivo NR local. Subiendo la lista de organismos: Se proporcionan dos opciones al usuario para cargar la lista de organismos. Uno es a través del teclado entrando al organismo en un campo de texto. La segunda forma es seleccionar un archivo que contiene la lista de organismos. Las secuencias se descargan en el archivo NRSCEXIENSI.FA en el directorio de descargas. Si se encontraron secuencias redundantes, se guardan en el archivo redencsencence.fa. Descargar la base de datos NR: Esta función proporciona al usuario descargar la base de datos NR de NCBI al sistema local. Hay un total de 4 partes de NR.00 a NR.03 disponibles para descargar. El usuario debe ingresar a qué parte para descargar (de 0 a 3). Cada archivo es de aproximadamente 800 MB de tamaño. y puede tardar varias horas en descargar según su velocidad de Internet. Comprobar el organismo: Esta utilidad se puede utilizar para verificar la exactitud del nombre del organismo dado conectándose a NCBI y validando.


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