Quimerabuster Una herramienta útil para el análisis de secuencia de quimera
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Quimerabuster Clasificación y resumen

Quimerabuster Etiquetas

secuencia Fastaja analizador de secuencias

Quimerabuster Descripción

Chimerabuster es una aplicación específicamente desarrollada para encontrar secuencias quiméricas putativas en bibliotecas de clones con alta cobertura. Las quimeras se forman durante la amplificación por PCR y están comprendidas secuencias de dos fragmentos (o más) derivados de otras dos secuencias (secuencias de padres). Por lo tanto, para que se formen quimeras, ambas secuencias de los padres deben existir durante el proceso de amplificación. Los programas de quimera existentes consultaron bases de datos de secuencias externas para buscar secuencias de padres. Sin embargo, para una gran cantidad de secuencias, es difícil concluir con una alta probabilidad de que se originaron a distintas secuencias de los padres porque no hay parientes suficientemente cercanos presentes en las bases de datos como GenBank o RDP. Dado que Chimerabuster está completamente escrito en el lenguaje de programación de Java, no debería haber problemas para ejecutarlo en una variedad de plataformas.

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