Visante

Análisis de vía se hizo fácil.
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Visante Clasificación y resumen

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  • Nombre del editor:
  • VisANT Team
  • Sistemas operativos:
  • Windows All
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Visante Descripción

Visant es una aplicación única, práctica, fácil de usar, especialmente diseñada para ayudarlo con el análisis de la red y la ruta. La visante está escrita utilizando el idioma de desarrollo de Java. Principales características: Análisis de enriquecimiento del módulo de red (NMEA) para detectar la diferencia fenotípica entre dos conjuntos de datos (por ejemplo, la expresión génica de la enfermedad V.S. Normal), pruebe NMEA para la ruta del ciclo celular en los datos mutantes P53. NMEA se está designado para encontrar módulos funcionales que informen las diferencias fenotípicas. Para la liberación actual, tales diferencias suelen ser la actividad transcripcional. NMEA por defecto se realizará para todos los metanodios no incrustados. La función está disponible en el menú Expression y requiere la entrada de datos de expresión (datos de expresión de muestra). Cuando se completa la ejecución de NMEA, los nodos en los módulos se colorearán de acuerdo con sus puntuaciones de enriquecimiento Ir a término en el análisis de enriquecimiento (ITEA) para encontrar los términos de GO superior representados en los módulos de red. La función está disponible en el menú del Metópulo y requiere que los genes en los módulos sean anotados. Modo por lotes automatiza las consultas de la base de datos para las interacciones, las resoluciones de nombres y las anotaciones, Modo por lotes para automatizar los procesos por lotes en el fondo y para manejar redes a gran escala con nodos y bordes de millones. META-GRÁFICO: Visualización de múltiples escalas de bio-redes, ideal para la red de módulos funcionales, Carga rápida de lote de grandes datos de interacción establecida a través de la página de estadísticas de interacción. Esquema visual flexible de la red: Anotación personalizada de Nodeedge, Minería de datos integrantes: 405K + Asociaciones funcionales (Experimental: 98924, computacional: 307017) Para 103 especies, Nombre de normalización para levadura, volar, Homo sapiens, etc., Alto rendimiento ajustable, admite la red grande, la prueba se ha realizado con 226K + bordes y nodos Easy HTTP que vincula a su red y soporte incorporado de alta resolución SVG Superposición de expresión de la red / camino Sistema de recomendación basada en datos de expresión integrada para el gen en la misma vía / complejo / red Navegación exploratoria de los caminos KEGG. Soporte de red ponderada con grosor de bordes, o color de borde, o ambos.


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