biofox

Extensión de Firefox que le dará una herramienta de bioinformática en su navegador web
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biofox Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Nombre del editor:
  • Saleem Mohammed
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  • 64 KB

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biofox Descripción

BIOFOX es una herramienta de bioinformática para los navegadores a base de Mozilla. El código BIOFOX tiene como objetivo implementar varias herramientas de bioinformática como una extensión en el navegador Firefox. El análisis de su (s) gen (s) gene (s) favorito (s) generalmente requiere (s) recuperándolo de una base de datos como NCBI o Swiss-Prot y luego realizando una o más tareas que incluyen, pero no se limitan a: · Traducción de una secuencia de nucleótidos. · Basta de explosión (por ejemplo, Blastn, Blastp, etc.) de la secuencia de nucleótidos / proteínas deseada. · Cálculo de propiedades (como PI, carga, peso molecular, contenido de AT / GC, etc.) de una secuencia de proteínas / nucleótidos. · Conversión entre formatos (GenBank, FASTA, SWISS-PROT, etc.) · Predicción de secuencia para la localización subcelular (Predotar, Targetp, Psort, etc.) Cada una de estas tareas requiere al menos los siguientes 4 pasos: · Visitar uno de los sitios web de la base de datos de secuencia, · Buscar el gen utilizando su nombre o ID de adhesión (ID ACC), · Copiando la secuencia del gen. · E importarlo a otros sitios web de bioinformática para un análisis posterior. BIOFOX facilita el análisis de las secuencias deseadas. Por ejemplo, seleccionando una secuencia y enviándola directamente a un sitio web de interés en particular. Requisitos: · Firefox: 1.0


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