jmodeltest Modelo filogenético con un promedio
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sistemática filogenética sustitución nucleótido análisis filogenético analizador filogenético huella filogenética contexto filogenético filogenético Compruebe la sonda filogenética Comprobador de la sonda filogenética Probar la sonda filogenética Red Pilogenética Calcule Sustitución de nucleótidos Modelo filogenético con un promedio modelo filogenético Almacenar la red filogenética. Analizar datos filogenéticos. Datos filogenéticos parsimonia de tareas filogenéticas Análisis filogenéticos construir supertrees filogenéticos crear supertrees filogenéticos Prueba de independencia filogenética. Análisis filogenético típico Hipótesis filogenética Relación filogenética Reconstrucción filogenética Topología filogenética Generador filogenético Promedio máximo

jmodeltest Descripción

JMODELTST es una aplicación científica que puede realizar una selección de sustituciones de nucleótidos, útiles en el análisis de ADN, con soporte para grandes paquetes de datos. Es un proyecto de plataforma de código abierto, multiplataforma que se dirige a estudiantes, maestros, así como investigadores en el campo de ADN. Sin embargo, la mayoría del análisis se realiza automáticamente, se espera que el conocimiento avanzado de nucleótidos se espera del usuario, principalmente para la interpretación de los resultados. JMODELTST se basa en el entorno de ejecución de Java para ejecutar con éxito, pero esa es la única dependencia que necesita para proporcionar. Viene envuelto dentro de un paquete portátil, por lo que no se requiere la instalación. La interfaz de JMODELTTS es bastante simple, pero las funciones incrustadas en su interior son de carácter más complejo. La mayor parte de la GUI está dedicada al análisis de los datos y los informes que resultan de este proceso, que, dependiendo de la información contenida dentro del archivo de origen, puede ser bastante largo. Hay cinco estrategias de selección diferentes y estas están incrustadas dentro del menú de análisis, de la siguiente manera: AIC (criterio de información de AQUAIKE), BIC (criterio de información bayesiano), DT (teoría de la decisión), HLRT (pruebas de relación de probabilidad jerárquica) y promedios filogénicos. Todos estos pueden configurarse antes del proceso de análisis real; Por ejemplo, puede ajustar el intervalo de confianza o configurar la aplicación para realizar un modelo de promedio. Para rematar, también puede instruir al programa que realice un cálculo de puntuación de probabilidad que depende de una variación de velocidad personalizable y un modelo de árbol de base preescrito. En conclusión, JMODELTST puede ahorrar el tiempo y el esfuerzo, los científicos invertirían en la realización de operaciones de análisis de ADN por medios tradicionales. Sin embargo, se recomienda que los resultados sean realmente verificados, por si acaso. Revisado por Andreea Matei, Última actualización el 17 de agosto de 2014

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