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Los patógenos viven y se reproducen dentro del huésped humano, cuyo sistema inmunológico continuamente trata de deshacerse del cuerpo de estos patógenos. Esto conduce a una tira de guerra entre el patógeno y el huésped humano, donde el patógeno intenta adaptarse para "escapar" del sistema inmunológico, mientras que el sistema inmunológico aprende a reconocer y eliminar nuevos patógenos extranjeros. Un conjunto de jugadores clave para el sistema inmunológico son las proteínas HLA, cada una de las cuales puede reconocer fragmentos cortos específicos de proteínas extranjeras (por ejemplo, VIH), llamadas epítopas, en células infectadas y luego alertar al sistema inmunológico a su presencia. Para los patógenos que evolucionan rápidamente como el VIH, un mecanismo de defensa clave es evolucionar mutaciones que impiden que las proteínas HLA reconozcan el ADN viral. Esta evolución se realiza de nuevo en cada paciente, ya que cada paciente tiene un conjunto diferente de proteínas HLA que reconocen diferentes epítopos. Phylod es una herramienta estadística que puede identificar mutaciones de VIH que derrotan la función de las proteínas HLA en ciertos pacientes, lo que permite que el virus escape la eliminación por el sistema inmunológico. Al aplicar esta herramienta a grandes estudios de pacientes infectados, los investigadores ahora pueden comenzar a decodificar las reglas complejas que rigen las mutaciones del VIH, con la esperanza de un día creando una vacuna a la que el virus no puede desarrollar resistencia. La aplicación Phylod Pre-Compiled es una parte del paquete de herramientas de Biología de Microsoft Computational. Requisitos: · NET Framework

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