Converger Evolución convergente y paralela en el nivel de secuencia de aminoácidos
Descargar ahora

Converger Clasificación y resumen

Converger Etiquetas

secuencia ácido fuente ácida Transacción ácida Encuentra aminoácido Buscador de aminoácidos buscar aminoácidos Analizador de aminoácidos secuencia de aminoácidos aminoácidos Traductor de aminoácidos tema ácido extraer aminoácido solución de ácido Residuos de aminoácidos aminoácido óptimo Secuencia de ácido nucleico analizar aminoácidos ácido nucleico analizar el par de aminoácidos Análisis de pares de aminoácidos Análisis de secuencia de aminoácidos Analizar la secuencia de aminoácidos. Clasificación de aminoácidos Topología de aminoácidos Evolución convergente Evolución paralela Convergente Detector de amino-ácido detectar aminoácidos Evolución de la secuencia Evolución de la secuencia de ADN Analizar la cadena de aminoácidos. Transacciones ácidas pro ácido ACID Pro 7

Converger Descripción

Esta solicitud se desarrolló para probar la evolución convergente y paralela en el nivel de secuencia de aminoácidos. Calcula las probabilidades de que las sustituciones convergentes y paralelas observadas son atribuibles a la posibilidad aleatoria. Este paquete contiene un programa: converg2.exe, que está escrito en lenguaje C. Para usar el programa, necesita un archivo de entrada que contenga las secuencias de aminoácidos y la topología de árbol de estas secuencias (consulte LYSOZYME.AA para un ejemplo). Este archivo comienza con dos números: el número de secuencias y el número de sitios de aminoácidos (longitud de secuencia). La segunda línea será el nombre de la primera secuencia, y la tercera línea será la primera secuencia, y así sucesivamente. Solo se permite el código de una letra (capitalizado) para los 20 aminoácidos en las secuencias. Las secuencias deben estar alineadas y las brechas o cualquier otro símbolo se eliminen ya. La última línea del archivo es la topología de árbol de las secuencias. El formato de árbol es el mismo que el utilizado en el paquete PHYLIP (Felsenstein 1995). Tenga en cuenta que el árbol no está enrojecido, por lo que se requiere la trificación en lugar de la biferación para el nodo de ramificación más profundo.

Converger Software relacionado