Gráfica de puntos Clasificación y resumen
- Nombre del editor:
- Ramin Charles Nakisa
- Sistemas operativos:
- Windows All
- Tamaño del archivo:
- 90 KB
Gráfica de puntos Etiquetas
Gráfica de puntos Descripción
Para la satisfacción rápida, intente comparar dos secuencias de subunidades de receptor de acetilcolina neuronal neuronal de Swissprot guardados bajo los nombres de archivos A2 y A3. La interfaz es como cualquier otro programa de Windows. Use el menú emergente de archivo para cargar la secuencia horizontal. Obtiene un cuadro de diálogo enumerando todos los archivos en el directorio actual. Seleccione A2, luego el programa le da un cuadro de diálogo SeqInfo, que le informa un poco sobre la secuencia que acaba de cargar IE. Su nombre, longitud, formato de secuencia y si su ADN, ARN o proteína. Haga clic en Aceptar. Luego repita para la secuencia vertical, eligiendo A3. Al igual que en la versión MSDOS, hay dos formas de calcular el dotplot, descrito en detalle a continuación. Para una solución rápida, use la opción de identidades en el menú emergente Dibujar. Los parámetros predeterminados son un tamaño de ventana de 10 y un umbral de 6. Esto le da una línea diagonal a través de su pantalla. Intente ajustarse el DotPlot haciendo clic en los parámetros y configurando el umbral a 1. Bonita, ¿no es así? Incluso puede ver las tres regiones transmembranas en el centro de la proteína y la transmembrana final en el C-Terminus. Trate de encontrar las repeticiones internas en un receptor de factor de crecimiento epidérmico humano. Para hacer esto, cargue la secuencia llamada EGFR como la secuencia horizontal y vertical. Luego, configure los parámetros como ventana = 20 y umbral = 1. Cargue la matriz PAM250.MAT Puntuación utilizando la opción Menú emergente de archivos "Abra Matrix". La aplicación DotPlot se desarrolló para ser herramienta de análisis de parcelas DOT.
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