Mrmodeltest C programa para seleccionar modelos de sustitución de ADN utilizando PAP
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Mrmodeltest Descripción

Comparar diferentes modelos de Evolution de ADN es una tarea reservada para un conjunto particular de usuarios, que tienen el conocimiento necesario para extraer información útil. También necesitan herramientas específicas para llevar a cabo la operación y MRMODELTST es una utilidad diseñada específicamente para el trabajo. TRABAJO EN LA APLICACIÓN DE CASA DE PRÓXIMA DE COMANDO NO ES NECESIONENTO NECESITA INSTALACIÓN Y ES ENSOLA. Esto podría distanciar a algunos de ellos, aunque una vez se inició, presenta las instrucciones adecuadas para usarla y los comandos y los argumentos admitidos. El desarrollador informa que la herramienta emplea pruebas de relación de probabilidad y AIC (criterio de información de Akaike), que mide una calidad relativa de un modelo estadístico para datos específicos. Los detalles adicionales proporcionados por el desarrollador se refieren a la cantidad de modelos de sustitución de nucleótidos respaldados por la aplicación, que se establece en 24, y todos ellos pueden especificarse en la herramienta de MrBayes (utilizados para la estimación bayesiana de la filogenia). Lista de comandos compatiblesSPITE Una interfaz gráfica de usuario, que trabaja con MrModeltest puede no ser demasiado difícil para los usuarios que se dirige, ya que la ventana de la consola muestra la lista de comandos compatibles. El programa permite seleccionar la jerarquía HLRT2 / 3/4, así como definir los niveles alfa y de depuración. Los ejemplos se presentan en la pantalla para facilitar las cosas. También existe la posibilidad de habilitar el modo de calculadora AIC o LRT y configurar el número de taxones. Para la mayoría de las operaciones, hay información sobre herramientas adicionales que pueden ayudar al usuario. Compare la evolución de ADN ModelSMRMODELTSTEST es un tenedor de la aplicación ModelTest que admite casi el doble de modelos de sustitución de nucleótidos. Pero su ventaja es que se pueden implementar en la utilidad MRBAYES para la estimación de la filogenia. Revisado por Ionut ILASCU, Última actualización el 2 de junio de 2014

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