Probabilidad de sinapomorfo

Evalúe la sinapomorfia de árboles filogenéticos con la ayuda de esta herramienta
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Probabilidad de sinapomorfo Clasificación y resumen

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  • Martin Turjak
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Probabilidad de sinapomorfo Etiquetas


Probabilidad de sinapomorfo Descripción

La probabilidad de Synapomorphy se diseñó como un guión R que implementa un nuevo método para evaluar la sinapomorfía en los árboles filogenéticos. Todo lo que tiene que hacer es instalar R y ejecutar el script. Un método que cuantifica el patrón de la distribución del estado de carácter en un cladograma y, como tal, está libre de cualquier modelo de transformación. La condición se define para un estado de carácter totalmente sinapomorfo como un estado de carácter compartido por todos los taxones terminales del clado y al mismo tiempo completamente ausente de todos los taxones terminales fuera de ese clado. La medida en que esta condición no se viole sirve para cuantificar la probabilidad de Synapomorphy. Esta probabilidad se calcula como una combinación de frecuencias de estado de carácter relativo dentro y fuera del clado en función de la estructura jerárquica del cladograma. Corresponde a la probabilidad de seleccionar aleatoriamente dos terminales que comparten el mismo estado de carácter dentro del clado y, al mismo tiempo, diferencia de todos los terminales externos.


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