SSA Un programa para inferir filogenías de probabilidad máxima de secuencias de ADN
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SSA Descripción

La SSA se desarrolló para ser un programa para inferir las filogenías de probabilidad máximas de las secuencias de ADN. Hay dos versiones del programa disponibles: una que asume un reloj molecular y que no hace este supuesto. El método para buscar el espacio de árboles para el árbol de ML se basa en un algoritmo de tipo de recocido simulado y se describe en la referencia anterior. El programa implementa el modelo F84 de F84 de Felsenstein y los Submátees asociados. El programa estima la longitud del árbol de ML y las ramas, y opcionalmente puede estimar la relación Transversión / Transversión. Tras la terminación, el programa devuelve los káticos K de mayor probabilidad encontrados durante la búsqueda, donde el usuario puede establecer K.

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