BIO :: POGGEN :: HTSNP

BIO :: POMGEN :: HTSNP.PM Módulo puede seleccionar HTSNP de un conjunto de haplotipos.
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BIO :: POGGEN :: HTSNP Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • Perl Artistic License
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Sendu Bala
  • Sitio web del editor:
  • http://search.cpan.org/~sendu/

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BIO :: POGGEN :: HTSNP Descripción

BIO :: POMGEN :: HTSNP.PM Módulo puede seleccionar HTSNP de un conjunto de haplotipos. BIO :: POPGEN :: HTSNP.PM Módulo puede seleccionar HTSNP desde un conjunto de haplotipos. HSYNOPSIS Use BIO :: POMGEN :: HTSNP; MY $ OBJ = BIO :: POGGEN :: HTSNP-> Nuevo ($ HAP, $ SNP, $ POP); Seleccione el conjunto mínimo de SNP que contiene la información completa sobre el haplotipo sin redundancias. Toma como ingresa los valores de seguimiento: - El bloque de haplotipo (matriz de matriz). - El ID de SNP (matriz). - Información y frecuencia familiar (matriz de matriz). El haplotipo final se genera en un formato numérico y los conjuntos de SNP se pueden recuperar del módulo. Consideraciones: - Si obliga a incluir una familia con indeterminación, los SNP con indeterminación se eliminarán del análisis, así que considere antes de colocar su Conjunto de datos. ¿Qué es lo que realmente quiere hacer? Si dos familias tienen la misma información (haplotipo idéntico), se eliminará uno de ellos y los archivos eliminados se almacenarán clasificados según se eliminan.- Solo se aceptan solo para el cálculo A, C, G, t y - (como eliminación) y sus combinaciones. ¿Algún otro valor como n o? Se considerará como degeneraciones debido a la falta de información. Requisitos: · Perl


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