Macs2 Clasificación y resumen
- Licencia:
- Artistic License
- Nombre del editor:
- Tao Liu
- Sitio web del editor:
- http://github.com/taoliu/
Macs2 Etiquetas
Macs2 Descripción
MacS2 es una herramienta de análisis basada en modelos para los datos de CHIP-SEQ. Con la mejora de las técnicas de secuenciación, la inmunoprecipitación de cromatina seguida de una secuenciación de alto rendimiento (CHIP-SEQ) se está volviendo popular para estudiar interacciones de la proteína-ADN de ancho genoma. Para abordar la falta de potente método de análisis de CHIP-SEQ, presentamos un nuevo algoritmo, denominado análisis basado en modelos de chip-seq (Macs), para identificar los sitios de enlace del factor de transcripción. MacS captura la influencia de la complejidad del genoma para evaluar la importancia de las regiones de chip enriquecido, y Mac mejora la resolución espacial de los sitios de unión mediante la combinación de la información de la posición de la etiqueta de secuenciación y la orientación. Las Mac se pueden usar fácilmente para los datos de CHIP-SEQ solos, o con la muestra de control con el aumento de la página de inicio de la especificidad.
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