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CLUSTERO DE SECUENCIA
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  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Alexey Stukalov
  • Sitio web del editor:
  • https://launchpad.net/~astukalov

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Sableador Descripción

Agrupamiento de secuencia SHEAFER es una utilidad para evaluar la agrupación jerárquica de las secuencias de proteínas. LaSheafer es una implementación de C ++ de varios métodos de múltiples métodos de alineación de secuencias (MSA) Predicción de residuos de agrupamiento y especificidad. Actualmente implementa: 1) agrupamiento por la optimización de la ambigüedad de la diversidad (DAO) (ver Dao.pdf); 2) agrupamiento por optimización de entropía de contraste (CEO). Este programa se basa en bibliotecas de BOOST C ++, el parser XML expatriado y el marco de cálculo evolutivo EO.


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