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Programa SEGM para la segmentación de las imágenes del SR.
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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Paul Hughett
  • Sitio web del editor:
  • http://www.med.upenn.edu/bbl/downloads/other/

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Segm Descripción

Programa SEGM para la segmentación del Sr. Imágenes del cerebro. Programa SEGM para la segmentación de las imágenes del Sr. del cerebro.segm es un conjunto de herramientas de análisis de imágenes desarrolladas y utilizadas por el laboratorio de comportamiento cerebral de la Universidad de Pennsylvania. Consiste en un conjunto de programas (BrainMask, KMEAN_3DSEG, y adpkmean_3dseg_ebeta) desarrollados originalmente por Michelle Yan para usar con protocolos específicos de imágenes MR utilizadas en el Laboratorio de Comportamiento del cerebro. Están destinadas al análisis cuantitativo de las imágenes de volumen de MRI, y particularmente para la segmentación automática en tipos de tejidos. Si bien estos programas se han mostrado muy efectivos para los protocolos en particular de las imágenes de la RM, no se han diseñado, no han demostrado adaptarse a otros protocolos de imagen. Por lo tanto, mientras siguen usándose en gran medida en BBL para el análisis de imágenes, no se recomiendan para nuevas aplicaciones. No anticipamos hacer más cambios en SEGM, excepto quizás para solucionar errores de paro o para admitir el intercambio de datos con programas más nuevos y más portátiles. BLBLImage es el kit de herramientas más reciente de Bbl para la imagen MR y puede ser de interés para los usuarios de SEGM; En cualquier caso, es, a menudo, preferible a SEGM para solicitudes nuevas. Los archivos de medios siempre se leen y escriben en el orden de Big-Endian, independientemente de la arquitectura nativa; Esto se hizo porque la mayoría o todos los archivos de imágenes en BBL se han generado y almacenados en la estación de trabajo SPARC, y parecía más fácil tener programas en todas las formas de lecturas de lectura y escribir este formato que para convertir constantemente los archivos de datos. Inicialización: SEGM tiene Ha sido compilado y corrido con éxito bajo Red Hat Linux 6.2 para Intel y Solaris 2.7 para SPARC. (La versión actual requiere el compilador de GCC, principalmente porque no hemos tenido tiempo para descubrir exactamente cómo compilar la biblioteca compartida con el compilador CC Sun.) Nos interesaremos escuchar sobre otros éxitos o fallos, y muy interesados ​​en recibir Correcciones que rendirán el éxito en otras máquinas y sistemas operativos. Si está instalando tanto BBLIMAGE como SEGM, debe instalar primero SEGM, luego BBLImage; Hay algunos archivos instalados que se comparten entre estos dos paquetes, y es más probable que BBlimage tenga la versión más reciente. Los siguientes pasos generalmente serán suficientes: 1. Desembale el archivo de alquitrán y el CD en el árbol de origen.2. Ejecutar "./configure" para adivinar los parámetros correctos para su máquina. Por defecto, `Hacer instalar 'instalará los archivos del paquete en` / usr / local / bin', `/ usr / local / hombre ', y` / usr / local / lib '. Puede especificar un prefijo de instalación que no sea '/ usr / local' dando 'configure' la opción '--prefix = ruta'. Por ejemplo, use ./configure --prevefix = / home / hughettto instale los programas en / home / hughett / bin, las páginas de hombre en / home / hughett / hombre, y la biblioteca compartida en / home / hughett / lib / 3 . Ejecute "Hacer" para compilar y vincular todo.4. Si usted es un programador, ejecute "Hacer etiquetas" para crear el archivo Etiquetas para Emacs; Si eres un VI Partisan, haz el cambio obvio en el Formulario First.5. Como root, ejecute "Hacer instalar" para instalar todos los binarios ejecutables y las páginas de hombre, generalmente en / usr / local / bin y / usr / local / hombre. (El prefijo macro en los controles de Makefile donde se instalan los archivos; Es posible que desee ver esto para asegurarse de que la configuración haya adivinado correctamente). 6. También es posible que necesite modificar las rutas de búsqueda de binarios y páginas de hombre (generalmente ruta y mancha) .7. La biblioteca compartida libsegm.so se instala en $ prefijo / lib; Es posible que deba agregar este directorio a la ruta de búsqueda (generalmente ld_library_path) para las bibliotecas compartidas.


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