Auxiliar Vea fácilmente SNPS en un contexto genérico
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Ver fácilmente SNPS en un contexto genérico AssociatsViewer es una aplicación de Java gratuita y de código abierto que se usa para mostrar SNP en un contexto genético. Los datos continuos (como genes o placamentos LD) se descargan de varias fuentes públicas de datos sobre la marcha y se guardan localmente en un caché. Los datos personalizados se pueden agregar como pistas complementarias. Aquí hay algunas características clave de "AssociatsViewer": · Pantalla SNP y sus valores P en un contexto genético, similar a los navegadores de genoma habituales · Descargar automáticamente información complementaria de Ensembl / Biomart · Mostrar parcelas Hapmap LD (que viene actualmente de la población CEU) · Crear informes (hechos de una o varias regiones de interés), que se pueden volver a cargar más tarde · Imprima y exporte la pantalla a varios formatos de datos. · Importar archivo de datos externos, como la cama o se mueve como pistas complementarias · No requiere tener una copia local de cualquier fuente o fuente de datos, excepto el archivo principal de SNP y sus respectivos valores P · Los usuarios pueden desplazarse y navegar a través de sus datos en tiempo real. · En tamaño pequeño (AssociSnViewer en sí es inferior a 500 KB, menos de 5 MB con las bibliotecas requeridas) · Los datos descargados se mantienen en un caché localmente para un acceso más rápido · Debido al caché, el requisito de memoria es razonable y debe ser constante a lo largo del tiempo (desde el momento en que se cargan los SNP en el momento en que se cierra la aplicación) Requisitos: · Java 1.6 · Un mínimo de resolución de pantalla de 1024 x 768 · Una conexión a Internet de trabajo · 256 MB RAM ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: errores corregidos: · 2816294: Error potencial al verificar las fuentes de datos externas. · 2816154: Insecto sobre los cambios recientes de HapMap. Características implementadas: · 2728254: Nuevo formato (XML) admitido para series de tiempo, consulte la documentación de AssociSViewer PDF para las especificaciones. · 2590069: No se muestran pistas vacías (no hay datos en el cromosoma seleccionado). · 2378292: New Library (FreeHEP) trae nuevas funciones de exportación para los formatos de mapa de bits y vectores. · 1969368: Esto está vinculado a la nueva característica anterior. Los formatos vectoriales se pueden utilizar para aumentar la resolución de exportación.

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