Color de malva Construye alineaciones múltiples globales de secuencias del genoma reorganizado
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Color de malva Descripción

Construye alineaciones múltiples globales de secuencias del genoma reorganizado. Malve es un sistema para construir de manera eficiente múltiples alineaciones genomas en presencia de eventos evolutivos a gran escala, como reorganización e inversión. La alineación de múltiples genomas proporciona una base para la investigación en genómica comparativa y el estudio de la dinámica evolutiva en una nueva escala. Alinear los genomas enteros es un problema fundamentalmente diferente que al alinear las secuencias cortas. Se ha desarrollado la idea de que un alineador de múltiples genomas debe requerir solo recursos computacionales modestos. MAUVE emplea técnicas algorítmicas que se escalan bien en la cantidad de secuencia alineada. Por ejemplo, un par de genomas de pestis puede estar alineado en menos de un minuto, mientras que un grupo de 9 genomas enterobacterianos divergentes se puede alinear en unas pocas horas. ¿Qué hay de nuevo en este lanzamiento: Nuevas características: · Compatibilidad con versiones anteriores de Mac OS X Errores corregidos: · La salida SNP ahora maneja archivos de secuencia de casos mixtos y caracteres de espacio · El uso de memoria alineador se ha optimizado, lo que resulta en requisitos reducidos de memoria para alineaciones con muchos genomas · Corrección para el error que evitó reordenar los beneficiarios de formato GenBank GenBank en la línea de comandos · Se corrigió un choque al generar mamás. · Informar un error cuando se utilizan secuencias que contienen huecos como entrada · Eliminar las nuevas líneas adicionales en la salida de alineación ortóloga · Se corrigió un error de dibujo de rectángulo de OpenJDK

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