Go-elite Aplicación de código abierto para análisis de ruta extendida
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identificar IR

Go-elite Descripción

Go-Elite es una herramienta de software diseñada para identificar un conjunto mínimo no redundante de términos o vías biológicos de ontología génica (IR) para describir un conjunto particular de genes. Además, las ontologías alternativas (p. Ej., Ontología de la enfermedad), los datos de metabolómicos y los conjuntos de genes y también pueden usarse como entrada. Esta herramienta calcula las estadísticas de sobrepresentación similares al programa PC MAPPFINDER y, posteriormente, produce resultados de vídeo y ruta filtrados junto con las anotaciones de genes correspondientes y datos de expresión resumidos. La versión 1 de Go-Elite 1 se proporciona como una solicitud independiente para Mac y PC y como código fuente multiplataforma en Python. Este software se puede ejecutar utilizando una interfaz de usuario gráfica intuitiva, a través de indicadores de línea de comandos o por WebService. El servicio web es accesible a través de un sitio web, programáticamente o utilizando el complemento GO-ELITE en CYTSOSCAPE. Las instrucciones detalladas sobre cómo instalar y usar la utilidad Go-Elite en su Mac están disponibles aquí.

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