Jspecies

herramienta basada en Fácil de usar y Java para medir la probabilidad si dos genomas pertenecen a la misma especie o no
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Jspecies Clasificación y resumen

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  • Rating:
  • Licencia:
  • GPL
  • Precio:
  • FREE
  • Nombre del editor:
  • Marine Microbiology Group
  • Sitio web del editor:
  • http://www.imedea.uib-csic.es/erm/mmg/DEPARTAMENTO/INDEX.html
  • Sistemas operativos:
  • Mac OS X
  • Tamaño del archivo:
  • 4.2 MB

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Jspecies Descripción

Herramienta fácil de usar y basada en Java para medir la probabilidad si dos genomas pertenecen a la misma especie o no Jspecies es un software gratuito, basado en Java, fácil de usar, y biólogo centrado diseñado para medir la probabilidad de que dos genomas pertenecen a la misma especie o NO.jspecies es capaz de calcular el promedio de nucleótidos promedio (ANI) basado en BLAST (ANIB ) y Mummer (anim). Los valores de ANI se basan en la alineación pareada de los estiramientos del genoma. La confiabilidad de sus resultados depende directamente de la cantidad y calidad del fragmento de ADN alineado. Requisitos: · Al menos 512 MB de RAM · Java


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