Msatcommander Esta aplicación de código abierto lo ayudará a localizar repeticiones de microsatélite, diseñar cebadores específicos de locus y etiquetarlos
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Msatcommander Clasificación y resumen

Msatcommander Etiquetas

búsqueda encontrar localizar encontrar duplicados localizar microsatellite Búsqueda de nucleótidos

Msatcommander Descripción

Esta aplicación de código abierto lo ayudará a localizar repeticiones de microsatélite, diseñar cebadores específicos de locus y etiquetarlos Msatcommander es un programa de Python escrito para localizar Microsatellite (SSR, VNTR, C) se repite dentro de la secuencia formateada por FASTA o los archivos de consenso. MSATFinder buscará todas las repeticiones de DI, TRI-, TETRA, PENTA- y HEXA-nucleótidos (con opciones para buscar menos tipos de repetición y combinaciones de tipos de repetición) .Msatcommander también etiquetará y diseñará los cebadores utilizando Primer3 como su imprimación Motor de diseño. Aquí hay algunas características clave de "Msatcommander": · Búsquedas para todas las repeticiones de mono-, di-, tri-, tetra, penta y hexanucleótido. · Las repeticiones se pueden combinar a través de distancias especificadas por el usuario (BP) · Diseña imprimaciones para repeticiones ubicadas. · Etiquetas y pruebas cebadores con M13R, CAG o TAG personalizada. La imprimación 'mejor' se informa al usuario. · Ofrece una GUI conveniente para la mayoría de los usuarios. · Las salidas resulta en formato CSV, para facilitar la importación al software de hoja de cálculo.

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