BbrowserBerkeley Quantitative Genome Browser | |
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Bbrowser Clasificación y resumen
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- Licencia:
- Freeware
- Nombre del editor:
- Michael Eisen
- Sistemas operativos:
- Windows All
- Tamaño del archivo:
- 5.3 MB
Bbrowser Etiquetas
- Navegador explorador Dominio de Nombre de Internet de Berkeley Navegador del genoma Genoma anotado Visualizar el genoma Genoma fichero búsqueda de la secuencia del genoma buscador de secuencias del genoma encontrar la secuencia del genoma analizar el genoma análisis del genoma analizador genomo Ver múltiple genoma Visor de múltiples genomas Búsqueda genoma Suite de análisis genoma Proteómica cuantitativa comparar el genoma del virus Visor de secuencia del genoma Mostrar secuencia del genoma Ver datos del genoma Visor de datos del genoma explorar el genoma Ver el genoma Genoma relacionado con cierre lenguaje genomo genoma procariot Análisis del genoma de Arabidopsis Ver Arabidopsis genoma Analizar el genoma de Arabidopsis Analizar el genoma bacteriano Visualización del genoma Visor del genoma Bioinformática del genoma de UCSC Asociación Genoma visualización circular genoma proteómico cuantitativo comparar genoma secuencia Analizador de comparación de genoma Secuencia del genoma Seguimiento del navegador del genoma UCSC gestionar la pista del genoma Administrador de pistas genoma analizar el genoma humano Calculadora del genoma Ver archivo de genoma Mapeo del genoma Visualización del mapa del genoma Arreglo de hibridación del genoma Mostrar datos del genoma Análisis del genoma humano Genoma humano Escáner del genoma Secuencia de genoma bacteriano Explorador del genoma Genoma cuantitativo genoma microbiano comparación del genoma cuantitativo caracterizar el genoma Caracterización del genoma Sistema de posicionamiento del genoma tasa de genoma Ver el genoma bacteriano Visualización del genoma bacteriano análisis cuantitativo Exploración de archivos Velocidad de entrada de datos navegador perno aplicaciones Navegador de la mina de la ópera Symbian 8 McCormick Place CAD Apple iPod A1204 Editor de MPG TS Trucos de matemáticas de velocidad gshellpack1.5 Subir por Ashampoo Video Editor
Bbrowser Descripción
El nombre Bbrowser representa el navegador de genoma cuantitativo de Berkeley. BQGB duplica gran parte de la funcionalidad de visualización de anotación típica de un navegador genómero, pero con un énfasis en datos personalizados y cuantitativos, como los que se producen en la secuenciación de alto rendimiento y los estudios de asociación de ancho genoma. La aplicación se ejecuta localmente en la computadora de escritorio o computadora portátil de un usuario, evitando el retroceso lento de los navegadores del genoma basados en la web. BQGB espera que los archivos de datos sean locales en el proceso de la aplicación y en un formato de archivo, como GFF, cama, SGR, WIG, FASTA o cualquier formato delimitado de la columna que proporcione ubicaciones de posición de secuencia y par de bases. Esta topografía generalmente debe ser más rápida que la de una base de datos remota central más navegador basada en la web cuando se trabaja con muchos archivos personalizados, es decir. ¡Descargar una sola anotación de referencia a la máquina local de uno es más rápido que la carga de cientos de archivos de datos personalizados a un servidor remoto! Las necesidades de navegación son variadas y se debe esperar que ninguna herramienta de visualización proporcione información sobre los diversos fenómenos de la genética molecular, desde los SNP altamente localizados, a elementos reguladores cercanos y lejanos, a las relaciones trans, a distantes relaciones trans que pueden incluso abarcar especies altamente divergentes. Más allá de las visualizaciones envasadas con BQGB, la aplicación proporciona una API de código abierto destinada a facilitar el trabajo de desarrollo continuo que aborda las necesidades de visualización y exploración en evolución de la investigación genética molecular.
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